Som lærestolsprofessor bliver Jørgen Frøkiær ansvarlig for forskningen på nuklearmedicinsk afdeling og PET Centret, der er en fælles afdeling ved Aarhus Universitet og Aarhus Universitetshospital, som udfører billeddiagnostik på molekylært plan. Afdelingens forskningsområder omfatter bl.a. udvikling af bedre diagnostik af hjerte- og karsygdomme. I samarbejde med onkologer og kirurger forskes der også i at forbedre de diagnostiske muligheder og behandlinger for en række forskellige kræftsygdomme. Jørgen Frøkiær har siden 2006 været medlem af Lundbeckfondens videnskabelige komité, og han er næstformand...